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조세특례제한법

2012-08-07 발의 · 의원 외 10인 · 기획재정위원회

제안이유 및 주요내용

제안이유

현재 영농조합법인 및 농업회사법인에 대하여는 작물재배업에서 발생한 소득에 대하여 법인세를 전액 면제하고 있으나, 영어조합법인에 대하여는 대통령령으로 정하는 범위의 금액에 대하여만 법인세를 면제하고 있으며, 어업회사법인의 경우에는 법인세 면제의 혜택이 없는 등 영어조합법인 및 어업회사법인이 영농조합법인 및 농업회사법인에 비하여 세제상 불이익을 받고 있는 실정임.

이에 영어조합법인 및 어업회사법인에 대하여 영농조합법인 및 농업회사법인과 같은 수준으로 세제 혜택을 받도록 하여 농업 분야와 어업 분야의 형평성을 제고하고 어업의 경쟁력을 제고하려는 것임.

또한 영농조합법인, 영어조합법인, 농업회사법인 및 어업회사법인에 대한 세제 혜택의 일몰기한을 연장하여 기업적 농업경영 및 어업경영을 세제 측면에서 계속 지원함으로써 농업 분야 및 어업 분야의 경쟁력을 강화하려는 것임.

주요내용

가. 영농조합법인의 농업소득 등에 대한 법인세 면제 등의 일몰기한을 2015년 12월 31일까지 3년 연장하도록 함(안 제66조).

나. 영어조합법인의 어업소득 등에 대한 법인세 면제 등의 일몰기한을 2015년 12월 31일까지 3년 연장하도록 함(안 제67조).

다. 영어조합법인 및 어업회사법인에 대하여 원양어업을 제외한 어로어업에서 발생하는 소득에 대하여 법인세를 면제하도록 함(안 제67조제1항 및 제68조의2제1항 신설).

라. 영어조합법인의 조합원 및 어업회사법인에 출자한 거주자가 받는 배당소득 중 어업소득에서 발생한 배당소득 전액에 대하여 소득세를 면제하도록 함(안 제67조제2항 및 제68조의2제4항 신설).

마. 어업인이 영어조합법인 및 어업회사법인에 수산동식물의 포획·채취·양식산업 및 염산업에 직접 사용되는 부동산을 현물출자하는 경우 이월과세를 적용받을 수 있도록 함(안 제67조제6항 및 제68조의2제3항 신설).

바. 농업회사법인의 농업소득에 대한 법인세 면제 등의 일몰기한을 2015년 12월 31일까지 3년 연장하도록 함(안 제68조).

사. 어업회사법인의 어업소득에 대한 법인세 면제 등의 일몰기한을 2015년 12월 31일까지로 함(안 제68조의2 신설).

신구조문 대비표

현행

개정안

제31조(중소기업 간의 통합에 대한 양도소득세의 이월과세 등)

현행 조문

현행제31조(중소기업 간의 통합에 대한 양도소득세의 이월과세 등) ① ∼ ④ (생 략)

개정안제31조(중소기업 간의 통합에 대한 양도소득세의 이월과세 등) ① ∼ ④ (현행과 같음)

현행⑤ 제63조에 따른 수도권과밀억제권역 밖으로 이전하는 중소기업 또는 제68조에 따른 농업회사법인이 제63조 또는 제68조에 따른 감면기간이 지나기 전에 제1항에 따른 통합을 하는 경우 통합법인은 대통령령으로 정하는 바에 따라 남은 감면기간에 대하여 제63조 또는 제68조를 적용받을 수 있다.

개정안⑤ --------------------------------------------------중소기업, 제68조에 따른 농업회사법인 또는 제68조의2에 따른 어업회사법인이 제63조, 제68조 또는 제68조의2------------------------------------------------------------------------------------------제63조, 제68조 또는 제68조의2-------.

현행⑥ (생 략)

개정안⑥ (현행과 같음)

제66조(영농조합법인 등에 대한 법인세의 면제 등)

현행 조문

현행제66조(영농조합법인 등에 대한 법인세의 면제 등) ① 「농어업경영체 육성 및 지원에 관한 법률」에 따른 영농조합법인(이하 “영농조합법인”이라 한다)에 대해서는 2012년 12월 31일 이전에 끝나는 과세연도까지 작물재배업에서 발생하는 소득(이하 “농업소득”이라 한다) 전액과 농업소득 외의 소득 중 대통령령으로 정하는 범위의 금액에 대하여 법인세를 면제한다.

개정안제66조(영농조합법인 등에 대한 법인세의 면제 등) ① ---------------------------------------------------------------------------------------------------------2015년 12월 31일----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행② 영농조합법인의 조합원이 영농조합법인으로부터 2012년 12월 31일까지 받는 배당소득 중 농업소득에서 발생한 배당소득 전액과 농업소득 외의 소득에서 발생한 배당소득 중 대통령령으로 정하는 범위의 금액에 대해서는 소득세를 면제한다. 이 경우 농업소득에서 발생한 배당소득과 농업소득 외의 소득에서 발생한 배당소득의 계산은 대통령령으로 정하는 바에 따른다.

개정안② ----------------------------------------------2015년 12월 31일----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------. ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행③ 영농조합법인이 조합원에게 지급하는 배당소득 중 제2항에 따라 소득세가 면제되는 금액을 제외한 배당소득으로서 2012년 12월 31일까지 받는 소득에 대한 소득세의 원천징수세율은 「소득세법」 제129조에도 불구하고 100분의 5로 하고, 이에 대해서는 지방소득세 소득분을 부과하지 아니하며, 그 배당소득은 「소득세법」 제14조제2항에 따른 종합소득과세표준에 합산하지 아니한다.

개정안③ -------------------------------------------------------------------------------------------------------2015년 12월 31일-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행④ 대통령령으로 정하는 농업인이 2012년 12월 31일 이전에 농지 또는 「초지법」에 따른 초지(이하 “초지”라 한다)를 영농조합법인에 현물출자함으로써 발생하는 소득에 대해서는 양도소득세를 면제한다.

개정안④ -----------------------------2015년 12월 31일-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행⑤⋅⑥ (생 략)

개정안⑤⋅⑥ (현행과 같음)

현행⑦ 대통령령으로 정하는 농업인이 2012년 12월 31일 이전에 영농조합법인에 「농어업·농어촌 및 식품산업 기본법」 제3조제1호가목에 따른 농작물재배업·축산업 및 임업에 직접 사용되는 부동산(제4항에 따른 농지 및 초지는 제외한다)을 현물출자하는 경우에는 이월과세를 적용받을 수 있다.

개정안⑦ -----------------------------2015년 12월 31일------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행⑧ (생 략)

개정안⑧ (현행과 같음)

제67조(영어조합법인 등에 대한 법인세의 면제 등)

현행 조문

현행제67조(영어조합법인 등에 대한 법인세의 면제 등) ① 「농어업경영체 육성 및 지원에 관한 법률」에 따른 영어조합법인[이하 “영어조합법인”(營漁組合法人)이라 한다]에 대해서는 2012년 12월 31일 이전에 끝나는 과세연도까지 각 사업연도의 소득 중 대통령령으로 정하는 범위의 금액에 대하여 법인세를 면제한다.

개정안제67조(영어조합법인 등에 대한 법인세의 면제 등) ① ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2015년 12월 31일----------------------------어로어업(원양어업은 제외한다)에서 발생하는 소득(이하 “어업소득”이라 한다)전액과 어업소득 외의 소득 중 대통령령으로----------------.

현행② 영어조합법인의 조합원이 영어조합법인으로부터 2012년 12월 31일까지 받는 배당소득중 대통령령으로 정하는 범위의 금액에 대해서는 소득세를 면제한다. <후단 신설>

개정안② ----------------------------------------------2015년 12월 31일----------배당소득 중 어업소득에서 발생한 배당소득 전액과 어업소득 외의 소득에서 발생한 배당소득 중 대통령령으로------------------------------------------------. 이 경우 어업소득에서 발생한 배당소득과 어업소득 외의 소득에서 발생한 배당소득의 계산은 대통령령으로 정하는 바에 따른다.

현행③ 영어조합법인이 조합원에게 지급하는 배당소득 중 제2항에 따라 소득세가 면제되는 금액을 제외한 배당소득으로서 2012년 12월 31일까지 받는 소득에 대한 소득세의 원천징수세율은 「소득세법」 제129조에도 불구하고 100분의 5로 하고, 이에 대해서는 지방소득세 소득분을 부과하지 아니하며, 그 배당소득은 「소득세법」 제14조제2항에 따른 종합소득과세표준에 합산하지 아니한다.

개정안③ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------2015년 12월 31일-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행④ 대통령령으로 정하는 어업인이 2012년 12월 31일 이전에 대통령령으로 정하는 어업용 토지 등을 영어조합법인과 「농어업경영체 육성 및 지원에 관한 법률」에 따른 어업회사법인에 현물출자함으로써 발생하는 소득에 대해서는 양도소득세를 면제한다.

개정안④ -----------------------------2015년 12월 31일----------------------------어업용 토지 또는 건물을 영어조합법인에-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행⑤ (생 략)

개정안⑤ (현행과 같음)

현행<신 설>

개정안⑥ 대통령령으로 정하는 어업인이 2015년 12월 31일 이전에 영어조합법인에 「농어업·농어촌 및 식품산업 기본법」 제3조제1호나목에 따른 수산동식물의 포획·채취·양식산업 및 염산업에 직접 사용되는 부동산(제4항에 따른 어업용 토지 또는 건물은 제외한다)을 현물출자하는 경우에는 이월과세를 적용받을 수 있다.

현행⑥ 제1항·제2항 및 제4항에 따른 면제신청과 제5항 본문에 따른 세액의 납부에 관하여는 제66조제6항 및 제8항을 준용한다.

개정안⑦ ----------------------------면제신청, 제5항 본문에 따른 세액의 납부와 제6항에 따른 이월과세적용신청-----------------------------------------.

제68조(농업회사법인에 대한 법인세의 면제 등)

현행 조문

현행제68조(농업회사법인에 대한 법인세의 면제 등) ① 「농어업경영체 육성 및 지원에 관한 법률」에 따른 농업회사법인(이하 “농업회사법인”이라 한다)에 대해서는 2012년 12월 31일 이전에 끝나는 과세연도까지 농업소득에 대한 법인세를 면제하고 농업소득 외의 소득 중 대통령령으로 정하는 소득에 대한 법인세를 제6조제1항을 준용하여 감면한다.

개정안제68조(농업회사법인에 대한 법인세의 면제 등) ① ---------------------------------------------------------------------------------------------------------2015년 12월 31일-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행② 대통령령으로 정하는 농업인이 2012년 12월 31일 이전에 농지 또는 초지를 농업회사법인(「농지법」에 따른 농업법인의 요건을 갖춘 경우만 해당한다)에 현물출자함으로써 발생하는 소득에 대해서는 양도소득세를 면제한다. 이 경우 제66조제5항부터 제8항까지의 규정을 준용한다.

개정안② -----------------------------2015년 12월 31일-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------. ---------------------------------------------------.

현행③ 대통령령으로 정하는 농업인이 2012년 12월 31일 이전에 농업회사법인에 「농어업·농어촌 및 식품산업 기본법」 제3조제1호가목에 따른 농작물재배업·축산업 및 임업에 직접 사용되는 부동산(제2항에 따른 농지 및 초지는 제외한다)을 현물출자하는 경우에는 이월과세를 적용받을 수 있다.

개정안③ -----------------------------2015년 12월 31일------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행④ 농업회사법인에 출자한 거주자가 2012년 12월 31일까지 받는 배당소득 중 농업소득에서 발생한 배당소득 전액에 대해서는 소득세를 면제하고, 농업소득 외의 소득 중 대통령령으로 정하는 소득에서 발생한 배당소득은 「소득세법」 제14조제2항에 따른 종합소득과세표준에 합산하지 아니한다. 이 경우 농업소득에서 발생한 배당소득과 농업소득 외의 소득 중 대통령령으로 정하는 소득에서 발생한 배당소득의 계산은 대통령령으로 정하는 바에 따른다.

개정안④ -------------------------------2015년 12월 31일-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------. --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행⑤ (생 략)

개정안⑤ (현행과 같음)

제68조의2(어업회사법인에 대한 법인세의 면제 등)

현행 조문

현행<신 설>

개정안제68조의2(어업회사법인에 대한 법인세의 면제 등) ① 「농어업경영체 육성 및 지원에 관한 법률」에 따른 어업회사법인(이하 “어업회사법인”이라 한다)에 대하여는 2015년 12월 31일 이전에 끝나는 과세연도까지 어업소득에 대한 법인세를 면제하고 어업소득 외의 소득 중 대통령령으로 정하는 소득에 대한 법인세를 제6조제1항을 준용하여 감면한다. ② 대통령령으로 정하는 어업인이 2015년 12월 31일 이전에 대통령령으로 정하는 어업용 토지 또는 건물을 어업회사법인에 현물출자함으로써 발생하는 소득에 대하여는 양도소득세를 면제한다. 이 경우 제67조제5항 및 제7항을 준용한다. ③ 대통령령으로 정하는 어업인이 2015년 12월 31일 이전에 어업회사법인에 「농어업·농어촌 및 식품산업 기본법」 제3조제1호나목에 따른 수산동식물의 포획·채취·양식산업 및 염산업에 직접 사용되는 부동산(제2항에 따른 어업용 토지 또는 건물은 제외한다)을 현물출자하는 경우에는 이월과세를 적용받을 수 있다. ④ 어업회사법인에 출자한 거주자가 2015년 12월 31일까지 받는 배당소득 중 어업소득에서 발생한 배당소득 전액에 대하여는 소득세를 면제하고, 어업소득 외의 소득 중 대통령령으로 정하는 소득에서 발생한 배당소득은 「소득세법」 제14조제2항에 따른 종합소득과세표준에 합산하지 아니한다. 이 경우 어업소득에서 발생한 배당소득과 어업소득 외의 소득 중 대통령령으로 정하는 소득에서 발생한 배당소득의 계산은 대통령령으로 정하는 바에 따른다. ⑤ 제1항, 제3항 및 제4항에 따른 감면신청, 이월과세적용신청 및 면제신청에 관하여는 제68조제5항을 준용한다.

제72조(조합법인 등에 대한 법인세 과세특례)

현행 조문

현행제72조(조합법인 등에 대한 법인세 과세특례) ① (생 략)

개정안제72조(조합법인 등에 대한 법인세 과세특례) ① (현행과 같음)

현행② 제1항 각 호의 법인(제1항 단서에 따라 당기순이익과세를 포기한 법인은 제외한다)에는 제5조부터 제14조까지, 제22조부터 제25조까지, 제25조의2부터 제25조의4까지, 제26조, 제30조의2, 제31조제4항부터 제6항까지, 제32조제4항, 제33조, 제33조의2, 제63조, 제63조의2, 제63조의3, 제64조, 제66조부터 제68조까지, 제94조, 제102조, 제104조의14 및 제104조의15를 적용하지 아니한다.

개정안② ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------제68조의2, 제94조---------------------------------------------------------.

현행③ ∼ ⑤ (생 략)

개정안③ ∼ ⑤ (현행과 같음)

제127조(중복지원의 배제)

현행 조문

현행제127조(중복지원의 배제) ① ∼③ (생 략)

개정안제127조(중복지원의 배제) ① ∼③ (현행과 같음)

현행④ 내국인이 동일한 과세연도에 제6조, 제7조, 제12조의2, 제31조제4항·제5항, 제32조제4항, 제33조의2, 제62조제4항, 제63조, 제63조의2제2항, 제64조, 제66조부터 제68조까지, 제85조의6제1항·제2항, 제104조의24제1항, 제121조의8, 제121조의9제2항, 제121조의17제2항, 제121조의20제2항, 제121조의21제2항 및 제121조의22제2항에 따라 소득세 또는 법인세가 감면되는 경우와 제5조, 제8조의3, 제11조, 제24조, 제25조, 제25조의2부터 제25조의4까지, 제26조, 제30조의4, 제94조, 제104조의14, 제104조의15, 제104조의18제2항, 제104조의22 및 제104조의25에 따라 소득세 또는 법인세가 공제되는 경우를 동시에 적용받을 수 있는 경우에는 그 중 하나만을 선택하여 적용받을 수 있다.

개정안④ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------제66조부터 제68조까지, 제68조의2----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행⑤ ∼ ⑨ (생 략)

개정안⑤ ∼ ⑨ (현행과 같음)

제128조(추계과세 시 등의 감면배제)

현행 조문

현행제128조(추계과세 시 등의 감면배제) ① (생 략)

개정안제128조(추계과세 시 등의 감면배제) ① (현행과 같음)

현행② 「소득세법」 제80조제1항 또는 「법인세법」 제66조제1항에 따라 결정을 하는 경우와 「국세기본법」 제45조의3에 따라 기한 후 신고를 하는 경우에는 제6조, 제7조, 제12조의2, 제31조제4항·제5항, 제33조의2, 제62조제4항, 제63조, 제63조의2제2항, 제64조, 제66조부터 제68조까지, 제102조, 제104조의24제1항, 제121조의8, 제121조의9제2항, 제121조의17제2항, 제121조의20제2항, 제121조의21제2항, 제121조의22제2항을 적용하지 아니한다.

개정안② -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------제68조의2, 제102조-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행③ 「소득세법」 제80조제2항 또는 「법인세법」 제66조제2항에 따라 경정(제4항 각 호의 어느 하나에 해당되어 경정하는 경우는 제외한다)을 하는 경우와 과세표준 수정신고서를 제출한 과세표준과 세액을 경정할 것을 미리 알고 제출한 경우에는 대통령령으로 정하는 과소신고금액(過少申告金額)에 대하여 제6조, 제7조, 제12조의2, 제31조제4항·제5항, 제33조의2, 제62조제4항, 제63조, 제63조의2제2항, 제64조, 제66조부터 제68조까지, 제102조, 제104조의24제1항, 제121조의8, 제121조의9제2항, 제121조의17제2항, 제121조의20제2항, 제121조의21제2항, 제121조의22제2항을 적용하지 아니한다.

개정안③ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------제68조의2, 제102조-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행④ 사업자가 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우에는 해당 과세기간의 해당 사업장에 대하여 제6조, 제7조, 제12조의2, 제31조제4항·제5항, 제33조의2, 제62조제4항, 제63조, 제63조의2제2항, 제64조, 제66조부터 제68조까지, 제102조, 제104조의24제1항, 제121조의8, 제121조의9제2항, 제121조의17제2항, 제121조의20제2항, 제121조의21제2항, 제121조의22제2항을 적용하지 아니한다. 다만, 사업자가 제1호 또는 제2호의 의무 불이행에 대하여 정당한 사유가 있는 경우에는 그러하지 아니하다.

개정안④ --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------제68조의2, 제102조-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------. ----------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행1. ∼ 3. (생 략)

개정안1. ∼ 3. (현행과 같음)

제132조(최저한세액에 미달하는 세액에 대한 감면 등의 배제)

현행 조문

현행제132조(최저한세액에 미달하는 세액에 대한 감면 등의 배제) ① 내국법인(제72조제1항을 적용받는 조합법인 등은 제외한다)의 각 사업연도의 소득과 「법인세법」 제91조제1항을 적용받는 외국법인의 각 사업연도의 국내원천소득에 대한 법인세(「법인세법」 제55조의2에 따른 토지등 양도소득에 대한 법인세와 같은 법 제96조에 따른 법인세에 추가하여 납부하는 세액, 가산세 및 대통령령으로 정하는 추징세액은 제외하며, 대통령령으로 정하는 세액공제 등을 하지 아니한 법인세를 말한다)를 계산할 때 다음 각 호의 어느 하나에 규정된 감면 등을 적용받은 후의 세액이 제1호 및 제2호에 따른 손금산입 및 소득공제 등을 하지 아니한 경우의 과세표준(제1호에 따른 준비금을 관계 규정에 따라 익금에 산입한 금액을 포함하며, 이하 이 조에서 “과세표준”이라 한다)에 100분의 14[과세표준이 100억원 초과 1천억원 이하 부분은 100분의 11, 과세표준이 100억원 이하 부분은 100분의 10, 중소기업 및 제85조의6에 따른 사회적기업의 경우에는 100분의 7(중소기업이 대통령령으로 정하는 바에 따라 최초로 중소기업에 해당하지 아니하게 된 경우에는 그 최초로 중소기업에 해당하지 아니하게 된 과세연도의 개시일부터 3년 이내에 끝나는 과세연도에는 100분의 8, 그 다음 2년 이내에 끝나는 과세연도에는 100분의 9로 한다)]를 곱하여 계산한 세액(이하 “법인세 최저한세액”이라 한다)에 미달하는 경우 그 미달하는 세액에 상당하는 부분에 대해서는 감면 등을 하지 아니한다.

개정안제132조(최저한세액에 미달하는 세액에 대한 감면 등의 배제) ① ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------.

현행1. ∼ 3. (생 략)

개정안1. ∼ 3. (현행과 같음)

현행4. 제6조, 제7조, 제12조의2, 제21조, 제31조제4항·제5항, 제32조제4항, 제33조의2, 제62조제4항, 제63조(수도권 밖으로 이전하는 경우는 제외한다), 제64조, 제68조(농업소득 외의 소득만 해당한다), 제85조의6, 제102조 및 제121조의22에 따른 법인세의 면제 및 감면

개정안4. ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------제68조의2(어업소득 외의 소득만 해당한다), 제85조의6------------

현행② ∼ ④ (생 략)

개정안② ∼ ④ (현행과 같음)

의안 원문

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본회의 표결

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